A auto-avaliação é um dos processos que compõem o Programa de Avaliação Institucional da UNISC. Desenvolve-se a partir da análise de dez dimensões institucionais:
- Missão e Plano de Desenvolvimento Institucional
- Políticas institucionais de graduação, de pesquisa e pós-graduação, de extensão e de gestão
- Responsabilidade social
- Comunicação com a sociedade
- Políticas de pessoal
- Organização e gestão
- Infra-estrutura física, Biblioteca, recursos de informação e comunicação
- Planejamento e avaliação
- Políticas de atendimento a estudantes e egressos
- Sustentabilidade financeira